1樓:匿名使用者
怎麼知bai道測序資料是轉錄組du還是基因zhi
轉錄組學的研究物件包括
daomrna和非編碼內rna等。新一代高通量測序技術可以
容全面快速地獲得特定細胞或組織在某乙個狀態下幾乎所有轉錄本的序列資訊和表達資訊,從而準確地分析基因表達差異、基因結構變異、篩選分子標記(snps或ssr)等生命科學的重要問題。
基因表達譜測序是直接對某一物種或特定細胞在某一功能狀態下產生的mrna進行高通量測序,可以用來研究基因的表達差異情況。該技術結合了轉錄組測序建庫的實驗方法,與轉錄組測序相比,基因表達譜測序要求的讀長更短,測序通量更小,但僅可用於基因表達差異的研究。
轉錄組測序是rna水平測序,相當於dna水平的基因組測序,是乙個框架。表達譜主要研究的是基因表達量的變化,上調或下降。先要有轉錄組或是基因組才可以做表達譜,否則沒有ref做參考。
轉錄組測序和表達譜測序其實都是通過高通量測序技術進行的,轉錄組測序主要是針對沒有參考基因組(即基因組未完成測序)的物種,側重於獲得你材料的全部轉錄組資訊;而表達譜則側重於檢測各個基因的表達量。
已經有轉錄組測序結果,怎麼看是否含有某個基因?
2樓:美吉生物
是有參考基因copy組的還是de novo的結果bai,如果有參考基du
因組的,那麼可以通過這個zhi基因名dao
稱在注釋結果中查詢是否有這個基因,序列資訊需要在參考基因組中查詢,如果是沒有參考基因組的,那麼拼接結果是乙個fasta格式的檔案,可以用blast軟體進行比對。
3樓:西門寒雪
有專門的軟體,你找你們老師一問就知道了,非常簡單的。
4樓:匿名使用者
貌似 木有什麼工作量吧 就是乙個比對而已
5樓:匿名使用者
用基因探針,可配對既含有某基因
轉錄組測序得資料怎麼判斷kegg富集顯著性
6樓:匿名使用者
轉錄組bai測序得資料怎麼判斷dukegg富集顯著性
提取樣zhi品總rna後,用帶有oligo(dt)的磁dao珠富集真核生版物mrna(若為原核生物,則用權試劑盒去除rrna後進入下一步)。加入fragmentation buffer將mrna打斷成短片段,以mrna為模板,用六鹼基隨機引物(random hexamers)合成第一條cdna鏈,然後加入緩衝液、dntps、rnase h和dna polymerase i合成第二條cdna鏈,在經過qiaquick pcr試劑盒純化並加eb緩衝液洗脫之後做末端修復、加a並連線測序接頭,然後用瓊脂糖凝膠電泳進行片段大小選擇,最後進行pcr擴增,建好的測序文庫用illumina hiseq? 2000進行測序。
已經有轉錄組測序結果,怎麼看是否含有某個基因
是有參考基因copy組的還是de novo的結果bai,如果有參考基du 因組的,那麼可以通過這個zhi基因名dao 稱在注釋結果中查詢是否有這個基因,序列資訊需要在參考基因組中查詢,如果是沒有參考基因組的,那麼拼接結果是乙個fasta格式的檔案,可以用blast軟體進行比對。有專門的軟體,你找你們...
spss怎麼知道一組資料是否有顯著差異
一組資料？不和組比較？單組資料的離散程度？方差或標準差就行呀 怎麼用spss檢驗兩組資料的差異是否顯著 檢驗方式 給出了兩組各 10 名品酒員對一批白葡萄酒和一批紅葡萄酒的品評結果，以及這兩批葡萄酒的相應理化指標及釀酒葡萄的相應成分指標。對兩組品酒員評判結果應用 t 檢驗分析判斷兩組評判結果的差異性...
我想知道這張驗光單的資料怎麼看，哪個是我的左眼，哪個是右眼
r，是右眼 l，是左眼。把這個條做乙個對折，上面的是屈光矯正資料，下面的就是角膜曲率資料，其中垂直向第二組資料，就是基弧。這個是電腦驗光單，這個資料不能作為驗光配鏡資料，只是給工作人員乙個參考，誤差可大可小，所以想知道確切的資料還是去專業機構檢查開具處方為好 首先和你說一來 下要注自意的問題，電腦驗...