1樓:南京金益柏生物科技****
多重實時定
復量pcr檢測bcr—abl intji.abmed,(hober2007,vo1.28,no.10多重實時制定量pcr 檢測bcr—ablmrna 方法
bai的建立 【摘du要】目的zhi建立一種快速,可靠dao的實時定量pcr(rq_pcr)檢測bcr-abimrna的方法. 方法應用lightcycler 技術,設計在同一pcr 反應管內可擴增b3a2,b2a2,ela2 幾種 常見的bcr— abi 轉錄本和b3a3,b2a3 等少見轉錄本,並對rq'pcr主要要素進行優化,評價優化 後rq_pcr 敏感性,特異性和可靠性.結果建立的rq_pcr 方法可檢出 lo 健康人單個核細胞 個k562細胞,最低可檢出100 個拷貝bcr—abi 分子.
bcr—abi 和abi 的迴圈域值(ct) 值(拷貝數)批內變 異係數分別為0.68(12.93)和0.
59(8.60),批問變異係數分別為1.14(18.
89)和1.0l (12.72).
結論 rq'pcr 可作為評價慢性粒細胞白血病(cml)疾病進展,預後判斷和 骨髓移植 後微量殘留白血病監測的靈敏,可靠的方法.
外周血檢測bcr-abl1定量pcr準確嗎
2樓:南京金益柏生物科技****
多重實時定來量pcr檢測
bcr—abl intji.abmed,(hober2007,vo1.28,no.10多重實時定量源
baipcr 檢測bcr—duablmrna 方法的建立 【摘要】目的zhi建立一種dao快速,可靠的實時定量pcr(rq_pcr)檢測bcr-abimrna的方法. 方法應用lightcycler 技術,設計在同一pcr 反應管內可擴增b3a2,b2a2,ela2 幾種 常見的bcr— abi 轉錄本和b3a3,b2a3 等少見轉錄本,並對rq'pcr主要要素進行優化,評價優化 後rq_pcr 敏感性,特異性和可靠性.結果建立的rq_pcr 方法可檢出 lo 健康人單個核細胞 個k562細胞,最低可檢出100 個拷貝bcr—abi 分子.
bcr—abi 和abi 的迴圈域值(ct) 值(拷貝數)批內變 異係數分別為0.68(12.93)和0.
59(8.60),批問變異係數分別為1.14(18.
89)和1.0l (12.72).
結論 rq'pcr 可作為評價慢性粒細胞白血病(cml)疾病進展,預後判斷和 骨髓移植 後微量殘留白血病監測的靈敏,可靠的方法.
bz 備註 患者外周血bcr-abl(p210)融合基因轉錄本檢測濃度低於檢測靈敏度(1:1
3樓:匿名使用者
分子生物學檢測報告結論檢測結果這個結果說明什麼?
送檢標本中bcr-abl1(p210)型融合基因陽性,定量檢查測結果為0.87%。是什麼意思???
4樓:匿名使用者
這個是懷疑慢性粒細胞白細胞是做的乙個檢查。
結果說明有0.87%的細胞室該基因突變陽性。這個定量的多少,可以用來監測**效果。
實時定量pcr的結果是怎樣分析的
5樓:小乾幹
1、如果有標準曲線,按照標準曲線計算。
2、一般都是相對量,則用delta delta ct方法來計算。
3、舉例如下:對照組基因a的ct值為20, 內參(比如βactin)ct值15。實驗組基因a ct值18,內參ct值14。
4、首先算加樣量:delta ct=15-14=1。2的1次方是2。
也就是說實驗組的加樣量是對照組的2倍。基因a: delta ct=20-18=2。
2的2次方是4。也就是說基因a的量在實驗組是對照組的4倍。但是由於加樣量是2倍,所以4處以2=2,最後的相對量是2倍。
5、幾點注意:必須確定擴增的特異性,只有相同目標的ct值才能相減(擴增效率有可能不同),2的某次方只是理論值,實際擴增效率低於2,最好不用syber green。
6樓:豆村長de草
實時螢光定量pcr技術是在pcr反應體系中加入螢光基團,利用螢光訊號積累實時監測整個pcr程序,最後通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法。
基線在pcr擴增反應的最初數個迴圈裡,螢光訊號變化不大,接近一條直線,這樣的直線即基線。光域值threshold的設定,一般將pcr反應前15個迴圈的螢光訊號作為螢光本底訊號,螢光域值是pcr3-15個迴圈螢光訊號標準差的10倍,螢光域值設定在pcr擴增的指數期。
融解曲線是用來驗證擴增產物特異性的,如果產物是單一條帶,融解曲線就會出現一尖峰;如果有引物二聚體或其它非特異性擴增,就會出現至少兩個尖峰。
擴充套件資料:
時螢光定量pcr儀real-time qpcr 常見問題分析:
1、無ct值出現
1)檢測螢光訊號的步驟有誤:一般sg法採用72℃延伸時採集,taqman法。則一般在退火結束時或延伸結束採集訊號;
2)引物或探針降解:可通過page電泳檢測其完整性;
3)模板量不足:對未知濃度的樣品應從系列稀釋樣本的最高濃度做起;
4)模板降解:避免樣品製備中雜質的引入及反覆凍融的情況。
2、ct 值出現過晚(ct>38)
1)擴增效率低:反應條件不夠優化,設計更好的引物或探針、改用三步法 進行反應、適當降低退火溫度、增加鎂離子濃度等;
2)pcr各種反應成分的降解或加樣量不足,
3)pcr產物太長:一般採用80-150bp的產物長度。
3、標準曲線線性關係不佳
1)加樣存在誤差:使得標準品不呈梯度;
2)標準品出現降解:應避免標準品反覆凍融,或重新製備並稀釋標準品;
3)引物或探針不佳:重新設計更好的引物和探針;
4)模板中存在抑制物,或模板濃度過高。
7樓:匿名使用者
實時定量pcr的結果是可以和所有核酸結合,沒有特異性。
要保證特異性的話,最好用其他的方法。擴增體系中加入模板dna的體積,比如同時10微公升的體系,對照組加1微公升dna,實驗組加2微公升dna,則實驗組的加樣量是對照組的2倍。
看ct值是分析螢光定量pcr最直觀的乙個資料,ct值一般在35左右就失去參考價值了,平時我們實驗室用biodai-pcr螢光定量法測得的擴增曲線的起跳值基本在30左右。
擴充套件資料:
real-time qpcr 常見問題分析:
一、無ct值出現
1、檢測螢光訊號的步驟有誤:一般sg法採用72℃延伸時採集taqman法。
則一般在退火結束時或延伸結束採集訊號。
2、引物或探針降解:可通過page電泳檢測其完整性。
3、模板量不足:對未知濃度的樣品應從系列稀釋樣本的最高濃度做起。
4、模板降解:避免樣品製備中雜質的引入及反覆凍融的情況。
二、ct 值出現過晚(ct>38)
1、擴增效率低:反應條件不夠優化,設計更好的引物或探針、改用三步法 進行反應、適當降低退火溫度、增加鎂離子濃度等。
2、pcr各種反應成分的降解或加樣量不足。
3、pcr產物太長:一般採用80-150bp的產物長度。
三、標準曲線線性關係不佳
1、加樣存在誤差:使得標準品不呈梯度。
2、標準品出現降解:應避免標準品反覆凍融,或重新製備並稀釋標準品。
3、引物或探針不佳:重新設計更好的引物和探針。
4、模板中存在抑制物,或模板濃度過高。
四、負對照有訊號、溶解曲線不止乙個主峰
1、引物設計不夠優化:應避免引物二聚體和髮夾結構的出現。
2、引物濃度不佳:適當降低引物的濃度,並注意上下游引物的濃度配比。
3、鎂離子濃度過高:適當降低鎂離子濃度,或選擇更合適的mix 試劑盒。
4、模板有基因組的汙染:rna提取過程中避免基因組dna 的引入,或通過引物設計避免非特異擴增。
五、擴增效率低
1、反應試劑中部分成分特別是螢光染料降解。
2、反應條件不夠優化:可適當降低退火溫度或改為三步擴增法。
3、反應體系中有pcr反應抑制物:一般是加入模板時所引入,應先把模板適度稀釋,再加入反應體系中,減少抑制物的影響。
8樓:寵愛認
常見分析角度:
1.無ct值出現
(1)檢測螢光訊號的步驟有誤:一般sg法採用72℃延伸時採集,taqman法則一般在退火結束時或延伸結束採集訊號;
(2)引物或探針降解:可通過page電泳檢測其完整性;
(3)模板量不足:對未知濃度的樣品應從系列稀釋樣本的最高濃度做起;
(4)模板降解:避免樣品製備中雜質的引入及反覆凍融的情況。
2.ct 值出現過晚(ct>38)
(1)擴增效率低:反應條件不夠優化,設計更好的引物或探針、改用三步法 進行反應、適當降低退火溫度、增加鎂離子濃度等;
(2)pcr各種反應成分的降解或加樣量不足,
(3)pcr產物太長:一般採用80-150bp的產物長度。
3.標準曲線線性關係不佳
(1)加樣存在誤差:使得標準品不呈梯度;
(2)標準品出現降解:應避免標準品反覆凍融,或重新製備並稀釋標準品;
(3)引物或探針不佳:重新設計更好的引物和探針;
(4)模板中存在抑制物,或模板濃度過高。
4.負對照有訊號、溶解曲線不止乙個主峰
(1)引物設計不夠優化:應避免引物二聚體和髮夾結構的出現;
(2)引物濃度不佳:適當降低引物的濃度,並注意上下游引物的濃度配比;
(3)鎂離子濃度過高:適當降低鎂離子濃度,或選擇更合適的mix 試劑盒;
(4)模板有基因組的汙染:rna提取過程中避免基因組dna 的引入,或通過引物設計避免非特異擴增。
5.擴增效率低
(1)反應試劑中部分成分特別是螢光染料降解;
(2)反應條件不夠優化:可適當降低退火溫度或改為三步擴增法;
(3)反應體系中有pcr反應抑制物:一般是加入模板時所引入,應先把模板適度稀釋,再加入反應體系中,減少抑制物的影響。
bcr/abl融合基因陽性是什麼意思
9樓:忘洛心
檢測結果是陽性,就表明存在該bcr-abl融合基因。
bcr/abl融合基因具有高度酪氨酸激酶活性,啟用多種訊號傳導途徑,使細胞過度增殖而使細胞調控發生紊亂。臨床上可以根據患者是否存在bcr/abl融合基因,來選擇性地使用分子靶向**藥物。
目前,bcr-abl 水平檢測因其結果簡單、準確且意義明確而被積極採用,且相對於細胞遺傳學水平來說檢測 bcr-abl 水平會更加簡便,僅需進行血液檢測,無需骨髓活檢。
國際臨床試驗結論來自 bcr-abl is 資料,cml **指南的制定也是基於這一指標。此外,bcr-abl 融合基因檢測對於前期 cml 疾病輔助診斷及後續靶向用藥指導及殘留病監測方面亦具有臨床意義。
ABL融合基因陽性是什麼意思BCRABL融合基因陽性是什麼意思
檢測結果是陽性,就表明存在該bcr abl融合基因。bcr abl融合基因具有高度酪氨酸激酶活性,啟用多種訊號傳導途徑,使細胞過度增殖而使細胞調控發生紊亂。臨床上可以根據患者是否存在bcr abl融合基因,來選擇性地使用分子靶向 藥物。目前,bcr abl 水平檢測因其結果簡單 準確且意義明確而被積...
正常人外周血中,中性粒細胞桿狀核和分葉核之間的比值是多少
正常時外周血中中性粒細胞的分葉以3葉居多,桿狀核與分葉核之間的正常比值為1 13.生理情況下,外周血中性粒細胞核通常以幾葉核為主 正常時外周血中中性粒細胞的分葉以3葉居多,桿狀核與分葉核之間的正常比值為1 13.問題分析 正常時外周血中中性粒細胞的分葉以3葉居多,桿狀核與分葉核之間的正常比值為1 1...
花崗岩需要檢測哪些專案石材檢測需要檢測哪些專案
花崗岩檢測標來準按照 gb t 18601 2009天然源花崗石建築板材 檢驗項bai目 毛光板平面度du zhi毛光板厚度dao 規格尺寸 平面度 角度 外觀質量 映象光澤度 乾燥壓縮強度 水飽和壓縮強度 乾燥彎曲強度 水飽和彎曲強度 體積密度 吸水率 耐磨度 放射性 astm c 615 03 ...