1樓：匿名使用者
現將blast的壓縮包上傳，並解壓縮（命令：tar zxvf blast2.2.20.tar.gz）
進入blast/bin目錄(命令：cd blast/bin)
將要查詢的fasta格式序列（比如：unigene資料），和資料庫檔案（比如：基因組資料）上傳到伺服器上，從左向右拖拽即可。（注意：查詢檔案和資料庫檔案都要求是fasta格式）
如何構建本地的blast資料庫？
2樓：澤速浪
假設有一序列資料（sequence.fa，多序列，fasta格式），欲自己做成blast資料庫，典型的命令如下：核酸序列：
62616964757a686964616fe59b9ee7ad9431333332633039$ ./formatdb –i sequence.fa –p f –o t/f蛋白序列：
$ ./formatdb –i sequence.fa –p t –o t/f執行blast:
獲得了單機版的blast程式，解壓開以後，如果有了相應的資料庫（db），那麼就可以開始執行blast分析了。
單機版的blast程式包，把基本的blast分析，包括blastn，blastp，blastx等都整合到了blastall一個程式裡面。
以下是一個典型的blastn分析命令：
(待分析序列seq.fa，資料庫nt_db)
$./blastall –p blastn –i seq.fa -d nt_db –w 7 –e 10 –o seq.blastn.out
（該命令的意思是，對seq.fa檔案中的核酸序列對nt_db資料庫執行blastn搜尋，視窗大小是7，e值限制是10，輸出的結果儲存到檔案seq.blastn.out 中）。
blastall的常用引數：
-p 程式名應該是blastn，blastp，blastx，tblastn，tblastx中的一個
-d 資料庫名稱，預設nr
-i 查詢序列檔案，預設stdin
-e e值限制，預設10
-o 結果輸出檔案，預設stdout
-f 過濾選項，預設t
-a 選擇進行運算的cpu個數
如何使用blast建立本地資料庫（我下了很多fasta檔案存放在一個資料夾裡）
3樓：
如果是想一次性執行完那隻能放在一個檔案裡面了
生物資訊學分析，blast後，如何由序列名匯出全部蛋白質序列？
4樓：
可以用指令碼，也可以用ncbi的工具。
用什麼做的blast，命令是什麼
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