誰來說說Illumina454ABI測序的區別

2021-03-03 20:27:42 字數 2521 閱讀 6287

1樓:匿名使用者

首先從原理上說復,illumina測序晶元是橋式擴制增,形成「簇」,終止子法,雙向測序;454是磁珠法擴增

,利用聚合反應副產物ppi後續反應,得到螢光;abi的solid系統同樣是磁珠法擴增,但利用的是連線反應(具體方法略顯複雜)。

其次從效能上說,illumina測序儀的通量極大,目前的hiseq x已經達到1.6-1.8t;454則是讀長最長(這三款);abi因為其連線反應測序的特點,其精度應該是最高的。

最後扒一扒他們的短兒,illumina**昂貴,尤其後期的極高通量的測序儀不是一般實驗室能承受的。同時他們的儀器或許都有人看管,指定該類儀器只能進行某種生物樣本的測序,當然其實價效比依然在;454的缺點,只在這三者中比的話,就是其同聚物準確度偏低;對於solid,就是讀長特別短,同時因為solid的測序原理,測序系統都相對複雜,因此solid系統不好公升級,到了目前似乎已經很少聽說solid系統了。

誰來說說illumina 454 abi 測序的區別

2樓:匿名使用者

首先bai從原理上說,illumina測序du晶元是橋式擴增,形zhi成「簇」,dao終止子法

版,雙向測序;454是磁珠法擴增,權利用聚合反應副產物ppi後續反應,得到螢光;abi的solid系統同樣是磁珠法擴增,但利用的是連線反應(具體方法略顯複雜)。

其次從效能上說,illumina測序儀的通量極大,目前的hiseq x已經達到1.6-1.8t;454則是讀長最長(這三款);abi因為其連線反應測序的特點,其精度應該是最高的。

最後扒一扒他們的短兒,illumina**昂貴,尤其後期的極高通量的測序儀不是一般實驗室能承受的。同時他們的儀器或許都有人看管,指定該類儀器只能進行某種生物樣本的測序,當然其實價效比依然在;454的缺點,只在這三者中比的話,就是其同聚物準確度偏低;對於solid,就是讀長特別短,同時因為solid的測序原理,測序系統都相對複雜,因此solid系統不好公升級,到了目前似乎已經很少聽說solid系統了。

高通量測序 illumina hiseq 2000 和roche454 兩種平台的區別

3樓:土豆檸檬絲

他們復是兩家不同公司的測序制平台

1.原理

illumina的hiseq2000和454都是通過單序列的擴增放大訊號,只是hiseq2000中間有橋式擴增,可以兩頭測序。測序長度來講,hiseq2000一般為1x100和2x100的模式,而454平均500bp左右,最長700左右,測序準確度來講hiseq的測序準確度稍高一些,454由於在測序的過程每次是加一種鹼基,所有如果是單鹼基重複,比如aaaa,那麼區分幾個a的準確性就會下降。

2.資料分析和應用方向

資料分析相差不大,只是不同的軟體,應用方面兩者各有優勢,hiseq2000資料適應性更高。454一般是巨集基因組種群豐度測序上應用更好一些,不過illumina也有miseq代替。

3.通量和**

hiseq2000的通量要高一些,**比454便宜很多。

綜合來講454現在應用面比較窄了,所以在市場上現在也慢慢被代替掉了。現在耗材和試劑也很快就停服務了。

不過hiseq現在市場上也都2500居多了,並且現在也有新的的技術更新的3000和4000。說實話現在hiseq2000也很少了。

三種高通量測序儀區別 比較?

4樓:匿名使用者

這些平台中,只有ion torrent 是最新的半導體測序技術,2年來發展速度很快。因此如果要客觀評價的話,需要檢視更新的平台比較的文章。推薦以下兩篇文章:

a tale of three next generation sequencing platform: ***parison of ion torrent, pacific bioscience and illuminar miseq sequencers

***parsion of next-generation sequencing systems

另外有訊息說,pgm的讀長已經達到400bp了,因此在通量上也應該會有相應的增加。

這是乙個高通量測序的戰國時代。誰能笑到最後,大家拭目以待!

5樓:匿名使用者

看一下這篇文章,這裡面有著三種平台的比較:

performance ***parison of benchtophigh-throughput sequencing platforms

裡面有通量、準確性、資料量、讀長等的比較。

第二代基因測序技術的流程分別是什麼,四種,roche 454測序技術,illumina solexa測序技術,abi solid測序

6樓:匿名使用者

454測序:dna文庫製備→empcr→上機測序

solexa測序:文庫製備→cluster擴增→邊合成邊測序

solid測序:樣品製備→emulsion pcr和底物準備→測序反應→影象收集→資料分析

7樓:美美

這一句兩句能說清楚嗎,逗人玩呢吧

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