1樓：匿名使用者
乙個從chip-seq資料中解碼長鏈非編碼rna和microrna基因轉錄調控的資料庫。
長鏈非編碼rnas（lncrnas）和micrornas（mirnas）代表了真核生物中兩類重要的非編手掘碼rnas。儘管這些非編碼rnas涉及到生物體發育和各種人類疾病，但是令人驚訝的是有關它們的轉錄調控知之甚少。染色體免疫沉澱和下一代dna測序（chip-seq）的最新進展已經以空前的敏感性提供了檢測轉錄因子結合位點（transcription factor binding sites，tfbss）的方法。
本研究中，我們描述了我們開發的乙個新資料庫以促進從chip-seq資料中進行轉錄因子結合圖譜和lncrnas與mirnas轉錄調控關係的喚穗綜合註釋和發現。chipbase的當前版本包括了通過在來自六種生物體的不同組織和細胞系中的543個chip-seq實驗產生的高通量測序資料。
通過分析數以百萬計的tfbss，我們鑑定了數以萬計的tf-lncrna和tf-mirna調控關係。此外，開發了兩個基於網路的服務和薯卜器以從chip-seq資料中註釋和發現lncrnas和mirnas的轉錄調控關係。另外，我們開發了兩個基因組瀏覽器deepview和genomeview，以提供多維資料的整合檢視。
而且，我們的網路實現支援不同的查詢型別及tfs、lncrnas、mirnas、基因本體論和通路的探索。
如何檢視乙個lncrna功能
2樓：生物資訊研究者
lncrna其實也是基因的一種轉錄本，所以你可以到那些rna相關的大資料庫比如ncbi，hgnc等。你也可以到那些專一收集整理lncrna的資料庫比如lncrnadb 這些資料庫中去查詢。。肯定能找得到。。
如何用chipbase查詢某個tf所調控的基因
3樓：朱合歡
chipbase還能上嗎，我完全進不去啊。。。求怎麼進去的。
怎麼從生信的免費資料庫中挖取lncrna研究線索
4樓：扶枋菲
delete from table_name 清除表中的所有資料、保留表結構truncate table table_name 清除表中所有行，保留表結構、與delete類似比delete速度快，而且效率高，使用的系統和事務日誌資源少drop table table_name 刪除表(所有資料及表結構)
果蠅基因組序列比對用什麼資料庫
5樓：匿名使用者
silva最好，其次greengene（很久沒更新了），rdp官網也提供資料庫；唯乎還有ncbi提供了人粗腔工矯正指凳悉過的16sdatabase。
6樓：
肯定準確的嘛~~序列是兩條鏈，雙向的啊。自己好好想清楚。
請問在哪裡可以找到 如果愛情可以 的歌詞
歌曲 曾經愛過你。歌手 鄭源 愛過的人。lrc歌詞 hot 列印預覽 曾經愛過你。詞 曉楓曲 曉楓。愛過的人。傻傻的想了很久。卻依然想不出分開的理由。你走的時候用沉默代替了分手。是你太殘忍還是我太認真。如果愛情可以瞬間忘記。我又何苦那麼的愛你。冰冷的空氣。穿透我的身體。冰凍我的心。你能看到我留在螢幕...
哪裡可以找到國外大學的課程輔導 10
可以找到國外大學的課程輔導 國外大學的課程輔導目前國內的機構還是很多的，主要看師資 教學經驗 專業匹配程度 授課模式等等。在國外當地會有各種型別的課程輔導機構，大多數機構 比較昂貴 有一些 便宜的輔導機構為小工作室，輔導老師師資和教學水平無法保障運猛高。輔導課程科目也比較有限，無法輔導統計學課程。在...
在哪裡可以找到各種疾病的資料
去醫學院圖書館啊，也可以上網查啊，不過醫學的書都是的，最好有目的的找。如何在網上查詢乙個疾病的所有相關基因？人類基因突變資料庫 the human gene mutation database,hgmd 是通用型資料庫的代表，全面收集了引起人類遺傳疾病或與人類遺傳疾病相關的基因突變。購買可諮詢 超低...